Percebi rsrs, eu não tinha visto mesmo. No caso do Saturn é bem provável que seja o dump do jogo que tu tem, normal funcionar no Yabause e não funcionar no Mednafen, eu só consegui rodar isos que sejam do Redump no Mednafen além claro, tem que ter as Bios certas, no meu pack eu já deixei. A mesma coisa vale pro PS1, é capaz que não tenham as bios pra jogos europeus e japoneses, e tem que verificar no arquivo .cue, se os caminhos estão certos.
Pra evitar esses problemas com dumps ruins é sempre bom baixar jogos de PS1 ou Saturn do grupo Redump, procure aí caso não conheça.
Então, o FatMatch só faz renomear pra bater com o nome da rom. É que nessa XML que tu usa está sem esses sufixos de região...
Eu mencionei acima sobre o gerador de XML automático, eu testei aqui e funciona porque na XML que ele gera vai estar o nome completo da rom "1942 (Japan-USA)" que vai bater com a "1942 (Japan-USA)" se não te importar com descrições eu recomendaria usar ele...
Ou então uma solução mais complexa mas que daria certo seria usar um programa chamado "Bulk Rename" para tirar os sufixos dos nomes das imagens em 2 passos você renomeia tudo: 1º passo: remover todos caracteres depois do "(" aí ficaria "1942 (" 2º passo: remover os dois últimos caracteres aí fica só "1942". Claro, dá pra fazer esse dois passos e renomear todas imagen de uma vez só.