Toda informação é válida e, com certeza houve alguma mudança seja para interação de algum canal on-line ou seja para uma tentativa (frustrada ou não) de bloquear o exploit ou ao menos seus usuários de jogarem on-line.
Eu decidi excluir a pasta update há um tempo, mas vinha procrastinando isso, com a update 5.5.3 decidi fazer, mesmo depois de relatos de que ela não teve efeito algum para quem usa exploit, até pensei na possibilidade dela recriar sozinha as pastas exluidas da Nand (pasta update por ex.), mas para comprovar isso alguém na 5.5.3 teria que deletar, testar um update e ver se a pasta voltou.
Eu vi num tópico que você estava com receio de fazer, vejo que somos parecido em questões de tanta segurança que ficamos inseguros em fazer certos procedimentos que somos competentes, lhe afirmo que este procedimento é bem tranquilho de fazer se estiver com os arquivos certos, no caso o ftpiiu_everywhere, fiz o procedimento numa rede sem conexão por prevenção e tudo correu bem.