Construir, em teoria, é a melhor opção pois pode moldar a casa do seu jeito, e aproveitar melhor a grana, especialmente no que diz respeito a acabamento (pintura, porcelanato, portas, pisos, etc).
Mas, como alguém que está construindo faz pouco mais de dois anos, te digo que nesse caso, o maior problema não é o dinheiro, e sim o nível de incômodo que terá com prestador de serviço. Construtor civil (vulgo pedreiro), em especial. Quando não fazem serviço porco, te deixam na mão. O único que não me incomodou com o serviço só podia trabalhar fora do horário comercial, mesmo sendo serviços pequenos que ficaram pendentes, demorou um eternidade.
Enfim, se for encarar, o ideal é ter alguém que possa acompanhar a obra com frequência, senão é certeza que terá dor de cabeça e principalmente desperdício de material.