O curso de Ciência da Computação tem como objetivo formar um profissional capacitado para atuar, principalmente, como pesquisador da computação como atividade-fim. CC é um curso de Exatas. Disciplinas clássicas de CC incluem várias disciplinas de Matemática, Redes, Sistemas Operacionais, disciplinas de programação e estrutura de dados. Existe a disciplina de SI em CC, mas é somente introdutória. O mais próximo que CC chega de SI é quando se estuda a fundo Engenharia de Software.
O curso de Sistemas de Informação, por outro lado, vai muito além do ambiente computacional. Um sistema de informação reúne sistemas computacionais, sistemas gerenciais e pessoais. A implementação de um SI numa corporação, por exemplo, requer engajamento de todos os níveis da corporação, ao passo em que a implementação de uma rede de computadores provavelmente não vai exigir muito mais do que o pessoal da informática. SI, é, portanto, considerada uma Ciência Social Aplicada, não uma Ciência Exata, e tem a computação como atividade-meio. E o curso, obviamente, tem que refletir isso.